عن عثمان بن عفان رضي الله عنه سمعت رسول الله صلى الله عليه وسلم يقول: (( من بنى مسجدا يبتغي به وجه الله بنى الله له بيتا في الجنة )) . وفي رواية (( بنى الله له مثله في الجنة )).
يعتبر بناء المساجد من المشاريع التي أولت المؤسسة الاهتمام بها، وخاصة إن الفلبين من الدول الفقيرة، ويقطن المسلمون في القرى والأماكن المتباعدة، والجزر النائية. كما إنهم يتميزون بأن كل مجموعة يسكن في ناحية، وأيضا إذا وجدوا مسجدا فإنهم يجتمعون في هذا المكان للسكن.
فبناء المساجد ضروري في تلك المجتمعات بالأحجام المختلفة، وحسب المكان والحاجة.
والمؤسسة بفضل الله تعالى ثم بتبرع أهل الخير من المحسنين الكرام وصل عدد المساجد التي بنتها أكثر من ألف مسجد، وهي مستمرة لهذا المشروع، حتى يعمّ البلاد بيوت الله تعالى، وليس لأحد عذر في ترك هذه الفريضة العظيمة إقامة الصلوات.
والمؤسسة لها قسم خاص، إدارة شؤون المساجد.
نسأل الله تعالى أن يجزي خيرا كل من مساهم في هذا المشروع العظيم.